פעילות בנק הדם מתבצעת ב-3 יחידות ייעודיות:
יחידת האפרזיס - מנהל פרופ אלדד דן
אפרזיס הינה מילה ביוונית שמשמעותה הפרדה . היחידה נותנת שירותים טיפוליים בפלסמה פרזיס, פוטופרזיס, לויקופרזיס ואחראית גם לאיסופי תאי אב מדם פריפרי. ביחידת האפרזיס מתבצעים גם איסופים יעודיים של טסיות וגרנולוציטים מתורמים עבור מטופלי המכון ההמטולוגי ומחלקת המטואונקולוגיה ילדים.
מעבדת בנק הדם - מנהלת: ד"ר לילך בונשטיין
המעבדה אחראית לקביעת סוגי דם, התאמה ואספקה של כל מוצרי הדם למטופלי בית החולים. מוצרי הדם המסופקים ע"י בנק הדם הם: כדוריות אדומות, טסיות, פלסמה וקריופרציפיטט . המעבדה נותנת שירות 24 שעות ביממה, 7 ימים בשבוע.
* התרמות דם אינן נערכות בבנק הדם של בית החולים אלא במגן דוד אדום בלבד אך נערכות התרמות של טסיות מתורם יחיד המבוצעות ביחידת האפרזיס.
ביחידה מתבצעים טיפולים לחולים עם תסמונות נוירולוגיות המוקלות על ידי טיפולי החלפת הפלזמה , טיפולים מצילי חיים לחולים עם מיקרואנגיופטיות , טיפולים להצלת שתל במקרי דחיה חריפה לאחר השתלת כליה, וכן טיפולי הרחקת כולסטרול LDL בחולים שלא הגיבו לטיפול מכסימלי בסטטינים.
יחידה זו הינה היחידה בארץ המבצעת טיפולי LDL אפרזיס לילדים הסובלים מהיפרכולסטרולמיה משפחתית שאינה מגיבה לסטטינים והחל ממשקל של 14 ק"ג, הילדים הללו מבצעים LDL אפרזיס.