היחידה לקרדיולוגיה ילדים ומומי לב מולדים במבוגר, מאבחן ומטפל במומי לב מולדים בעוברים, בילודים, בתינוקות וילדים מתפתחים, כולל נערים ונערות. המכון מספק שירותי מעקב וטיפול בתקופת הפריון וכן, למבוגרים, אשר בגרו תוך כדי המעקב או אובחנו בבגרותם כבעלי מום לב מולד.
השירותים כוללים הערכה סיעודית, והערכה ובדיקה רפואית. בדיקות משלימות של תרשימי א.ק.ג. במנוחה ובמאמץ, רישומי הולטר א.ק.ג. - לאיתור הפרעות בקצב הלב, והולטר לחץ דם - לאבחון ואופטימיזציה של הטיפול. וכן, בדיקות אקו-דופלר, להערכה מבנית ותפקודית של הלב, בכל הגילאים.
היחידה נעזרת בהדמיה תלת ממדית של הלב, לאיתור הפרעות ולשיפור הטיפול. כמו כן, מתבצעות בה פעולות משולבות של צנתור, בפיקוח רנטגן ואקו- ושט, המהוות חלופה לניתוח לב פתוח.
היחידה לקרדיולוגיה ילדים, תומך במטופלים המאושפזים במחלקות השונות של ביה"ח. בנוסף, מפעילה היחידה שרות היקפי נייד, לילדים ומבוגרים עם מומי לב מולדים, בצפון ישראל, בבתי חולים היקפיים ובמרפאות הילדים.