במכון פועלות מספר מרפאות ייעודית: מרפאה ליתר לחץ דם ריאתי, מרפאה משותפת לחולים במחלות רקמת החיבור עם מעורבות ריאתית (פיברו-ואסקולרית), מרפאה לחמצן ולתומכי נשימה כמו גם, מעבדה מתקדמת לתפקודי נשימה. כמו כן, מתבצעת במכון פעילות מחקרית ענפה, כגון: מחקר הבודק את הקשר בין אסטמה לדום נשימה בשינה, מחקר הבודק היבטים קליניים ואפידמיולוגיים של סרקואידוזיס בצפון מדינת ישראל ועוד.
בנובמבר 2021 הוקם במכון ריאות רמב"ם מרכז לאבחון מהיר של סרטן הריאה, ובו מומחים מדיסציפלינות שונות נותנים מענה מהיר ומקצועי למטופלים עם חשד לסרטן הריאה. האבחון הראשוני הקריטי מושלם תוך שבועיים לכל היותר והמטופל מופנה להמשך טיפול.