מחלקת נפרולוגיה מטפלת בחולים עם אי- ספיקת כליות חריפה וכרונית.
במחלקה נערכות בדיקות מקיפות לחולים עם מחלות כליה, כולל ביופסיות כליה וטיפול במקרים של יתר לחץ- דם קשים והפרעות במלחי הגוף.
מחלקת נפרולוגיה מבצעת המודיאליזות, כולל דיאליזות דחופות, לחולים המאושפזים במחלקות אחרות, לחולים שאינם מטופלים ברמב"ם או הסובלים מאי- ספיקת כליות חריפה.
בנוסף, מבצעת המחלקה השתלות כליה, הן מן המת והן מהחי, כולל הכנת מועמדים להשתלה ומעקב אחרי הבדיקות שלהם, וקליטת מושתלים החוזרים מחו"ל. היא משמשת כמרכז היחיד בצפון הארץ, הנותן שירות למושתלים מכל האיזור.
כמו כן, מפעילה המחלקה מרפאת חוץ נפרולוגית, הכוללת בתוכה מחלות כליה, אלקטרוליטים, יתר לחץ דם, סכרת ופרידיאליטית. זאת בנוסף ליחידת דיאליזה קהילתית הממוקמת בקרית-ביאליק. לרשות המחלקה עומד מערך שלם למתן יעוץ לכל מחלקות הקריה הרפואית רמב"ם.
מחלקת נפרולוגיה משמשת כמקום עיקרי ללימוד סטודנטים לרפואה בתחום. בנוסף לעבודתם הקלינית ולימוד סטודנטים לרפואה, משתתפים רופאי המחלקה הן במחקר קליני והן במחקר בסיסי.