המחלקה לאנדודונטיה וטראומה דנטלית, שהינה חלק אינטגרלי מבית הספר לרפואת הפה והשיניים, עוסקת בטיפולי שרש וטיפולי שיניים לאחר חבלות. המחלקה מבצעת טיפולי שורש רגילים או מסובכים יותר, כמו חידושי טיפולי שרש, אשר מחייב מסגרת רפואית כגון בית חולים ו/או מעורבותו של מומחה באנדודונטיה. ????
במחלקה מבוצעים גם ניתוחים מסוג אפיסקטומי (קיטום קצה השורש), בעזרת ציוד מיוחד, אשר מעלה את סיכוי ההצלחה בצורה משמעותית.
מחלקת אנדודונטיה הוקמה במסגרת בית החולים תוך שימת דגש לטיפול בחבלות שיניים והשלכותיה והיא נותנת מענה לתושבי חיפה והצפון, וכן למטופלים מאוזרים אחרים בארץ, כולל תושבי חוץ.
לרשות המרפאה והחולים המטופלים בה, עומדים האמצעים הרפואיים המתקדמים ביותר, הן בתחום הדנטלי והן בתחום ההדמיה, לרבות מומחים מייעצים ממחלקות אחרות, בתחומים רפואיים שונים.
רופאי המחלקה עוסקים, בנוסף לעבודתם הקלינית, גם בהוראה אקדמית ובמחקר בסיסי ויישומי.