המחלקה לתזונה קלינית אחראית על הטיפול התזונתי במחלות ובמצבים ספציפיים, לרבות טיפול תזונתי תומך בחולים המאושפזים בביה"ח ובחולי המרפאות. זאת, במטרה לשמור על סטאטוס תזונתי אופטימלי ולהבטיח תמיכה הולמת, שתשפר את סיכויי החולה להתמודד עם המחלה. כמו כן, מתווה המחלקה את מדיניות הטיפול התזונתי בבית החולים ויוזמת טיפולים חדשניים, תוך שימוש בתכשירי הזנה מתקדמים.
בתחום האשפוז מספקת המחלקה טיפול תזונתי אינדיבידואלי, בעיקר באמצעות תכשירי הזנה ייעודיים - לחולי סכרת ומחלות דרכי העיכול, לחולים לאחר ניתוחים ולמאושפזים במחלקות טיפול נמרץ, נפרולוגיה, אונקולוגיה ועוד.