המכון למחלות זיהומיות פועל למניעה והפחתה של זיהומים בקרב חולים המאושפזים בקריה הרפואית, רמב"ם.
המכון אחראי על מציאת דרכי התמודדות עם המגוון הרחב של זיהומים (חיידקים, נגיפים, פטריות, טפילים, וכו"), הנרכשים בקהילה או בבית החולים. זוהי למעשה, הזרוע האחראית בבית החולים על ההתמודדות עם בעיית הביו-טרוריזם, עם זיהומים הנרכשים במערכת הבריאות, גורמים ומחלות חדשות, המתגלים חדשות לבקרים, וחיידקים המגבירים את עמידותם לאנטיביוטיקה.