היחידה לאימונולוגיה קלינית מספקת שירותים בארבעה תחומים עיקריים:
שירות יעוץ למחלקות ולמכונים
רופאי היחידה משתתפים בישיבות הוראה ודיון של המחלקות והמכונים השונים ומעניקים ייעוץ לגבי חולים המאושפזים עם בעיות אימונולוגיות.
שירות הייעוץ ניתן גם לבתי חולים פריפריים, לגבי חולים אינדיבידואלים.
שירות מרפאתי
המרפאה נותנת שירות לחולים אלרגיים, חולים במחלות אוטואימוניות, חולים במחלות חסר חיסוני ראשוני ונשאי וחולי איידס.
בנוסף, ניתן שירות מרפאתי רפואי/סיעודי במרכזי קליטה שונים.
הוראה והדרכה
הוראה והדרכה מטעם המכון ניתנים לרופאים, לעובדי מעבדות ולסטודנטים. ההדרכה נעשית במסגרת פגישות צוות וכן במסגרת הרצאות מוזמנות. כמו כן מתבצעת הדרכה לרופאי קופת חולים במסגרת השתלמויות באימונולוגיה ובאלרגיה, הנערכות בקריה רפואית, רמב"ם.