יחידת האשפוז של המחלקה להמטולוגיה ואונקולוגיה לילדים, כוללת עשרה חדרי אשפוז המשמשים למתן טיפול כימותרפי, קרינתי וטיפול תומך. חלק מהחדרים הינם חדרים בודדים וחלקם מיועדים עבור שני ילדים.
כל חדר מצויד במקלחת ושירותים, טלוויזיה, וידאו וכן, מיטה מתקפלת לצד מיטת הילדהחולה, המאפשרת להורים גם לישון לצד ילדיהם, לנוחיות הילד ומשפחתו.
בנוסף, כוללת יחידת האשפוז:
חדרי טיפול ותחנת אחיות, פינת הורים ומטבחון, לנוחיות המשפחה השוהה עם הילד, כיתת לימוד לילדים המאושפזים, הכוללת משחקים, עמדות מחשב עם חיבור לאינטרנט, ספרים, משחקי מחשב, עבודות יד ועוד.
ביחידת אשפוז הלילה של המחלקה מאושפזים ילדים עם מחלות סרטן, מחלות דם ממאירות ושפירות, וכן ילדים העוברים השתלות מח עצם. היחידה ערוכה לתת מענה רפואי מתקדם 24/7, עם צוות רפואי וסיעודי מיומן ובעל ניסיון רב. במהלך האשפוז מקבלים הילדים את כל הטיפולים הנדרשים להם – כימותרפיה, טיפולים ביולוגיים, אנטיביוטיקה, מוצרי דם ותרופות תומכות – תחת השגחה רפואית צמודה וניטור מתמשך.