האגף הפנימי מאגד את הטיפול בכל המגוון הרחב של המחלות הפנימיות. האגף מונה את 5 מחלקות האשפוז החריף (פנימית א-ה) ואת המחלקות העל-פנימיות: נפרולוגיה, קרדיולוגיה והמטולוגיה, כמו גם את מחלקת עור, נוירולוגיה ואונקולוגיה. בנוסף, מקיף האגף מספר רב של מכונים ויחידות, כדוגמת ראומטולוגיה, אנדוקרינולוגיה, גסטרואנטרולוגיה, כבד, ריאות, מחלות זיהומיות, פרמקולוגיה קלינית ואימונולוגיה קלינית.
זהו האגף העמוס ביותר בבית החולים, הנותן שרות רפואי, הן באשפוז והן במסגרת מרפאתית, כולל במכונים, לאלפי חולים כל חודש.
