רפי נולד בבית חולים רמב"ם להוריו סוניה ושי בן חקון.
גדל והתחנך בקריית חיים, למד בב"ס דגניה ואחרי כן בחטיבה של תיכון קריית-חיים.
בבית הוריו ספג ערכים של התנדבות, אהבת הארץ, המולדת והגיוס לצה"ל .
בגיל 15 עקב מעבר הוריו לישוב הקהילתי רמת ישי, החל רפי ללמוד בבה"ס החקלאי "ויצו נהלל" שם סיים את לימודיו במגמת חשמל ואלקטרוניקה.
עם המעבר לרמת ישי, אופיו הנוח והחברי עזרו לו לרכוש חברים רבים שהפכו לחברים בנפש, ורפי היה אהוב על כל חבריו.
בשנת 1996 התגייס לצה"ל ושירת כטכנאי מערכות אופטיות וכתומך לחימה בעוצבת
"חירם" החטיבה המרחבית הצפונית 769 .
את מרבית שירותו עשה בדרום לבנון, כשהוא עובר ממוצב למוצב ומיחידה ליחידה, לתת את השרות ללוחמים ובליווי שיירות עם ציוד לזיהוי ופיצוץ מטעני צד.
כשנה וחצי לפני סיום שירותו הצבאי החלו להופיע סימנים ותופעות פיזיים שרופאי היחידה לא זיהו ולא דאגו לשלחו לבדיקות למרות אופי תפקידו.
חודש לאחר שירותו החמירו התופעות והתגלתה אצלו מחלת סרטן הדם – לוקמיה .
מחלה בה לקה עקב תפקידו הצבאי אשר דרש ממנו התעסקות עם חומרים פולטי קרינה רדיו-אקטיבית ושהות בסביבה עם רמת קרינה גבוהה לאורך זמן רב, ללא ציוד מתאים וללא בדיקות תקופתיות כפי שמחייב החוק לגבי חיילים בתפקיד זה.
רפי עבר טיפולים רבים והשתלת מח עצם שתרם לו אחיו הצעיר.
לתקופה מסוימת מצבו הוטב והיה נדמה שהוא מנצח את המחלה.
לאורך כל התקופה רפי שמר על מצב רוח טוב ואופטימיות רבה, תכנן תוכניות לעתיד ארגן עם חבריו טיולים ומסעות אופניים, התחיל ללמוד לימודי הנדסה "באורט בראודה" שבכרמיאל. הוא עסק בתחביביו הרבים נגינה בגיטרה, ציור, גילוף בעץ ופיסול, ורכיבה על אופני שטח.
לרוע המזל בשנת 2004 פרצה המחלה שוב ולמרות כל הטיפולים שעבר, המחלה הכניעה אותו, כשהוא מוקף באוהביו ומשפחתו.
רפי ניפטר ב- 1.9.2005 - לאחר פטירתו הוכר כחלל צה"ל.
יהיה זכרו ברוך ונצור בליבנו לעד!
אחיה של ורד בן חקון ביטל מיחידת כבד.