האגף הכירורגי בקריה הרפואית רמב"ם, מאגד תחתיו את כל המחלקות והיחידות המתמחות בסוגים השונים של הכירורגיה, ביניהן: אורולוגיה, לרבות אורולוגית ילדים, אורודינמיקה, המערך האורתופדי, כירורגיה פלסטית, לרבות שחזור שד ואסתטיקה, כירורגית חזה, לב וכירורגית כלי דם. כמו כן, כירורגית אף, אוזן, גרון וניתוחי ראש וצוואר, כירורגית עיניים, כירורגית פה ולסת וכן, היחידות לכירורגיה כללית.
בנוסף, אחראי האגף הכירורגי על ניהול כוח האדם של הרופאים והתיאום בין המחלקות.
האגף עוסק גם בפיתוח ושדרוג תחום הכירורגיה בבית החולים, על ידי הרחבת תמהיל הניתוחים, יישום טכנולוגיות מתקדמות, ריכוז ועדות חיפוש לתפקידים בכירים באגף, קליטת כירורגים בעלי מומחיות מיוחדת ועוד.
צוות האגף הכירורגי לוקח חלק, באופן שוטף, בתוכניות מחקר, לימוד והדרכה, הכוללים בין השאר, הדרכת מתמחים עפ"י הנחיות המועצה המדעית, שליחת רופאים לתתי-התמחויות בחו"ל ויצירת מנגנוני שיתוף פעולה בתחומים ספציפיים, בין המרכז הרפואי רמב"ם למרכזים רפואיים מקבילים, לרבות תמיכה ועידוד פעילות מחקרית.