מחלקת נוירולוגיה מאבחנת ומטפלת במחלות מערכת העצבים, כולל הפרעות במוח, חוט השדרה, בעצבים ההיקפים, מעבר עצב-שריר ומחלות השריר.
הטיפולים כוללים גם את הטיפול הייחודי הדחוף בחולי שבץ מוחי, באמצעות מתן TPA להמסת קרישים, בשלב המוקדם (3-6 שעות) של האירוע המוחי.
המחלקה מתפקדת כמערך כוללני לאבחון וטיפול באפילפסיה, כולל וידאו-EEG, מרפאת קוצבים, פעילות של קבוצות תמיכה לחולים ובני משפחותיהם ומרפאת הפרעות תנועה, המשלבת טיפולים בתרופות חדשות ומתקדמות.
במחלקה הנוירולוגית פועלת מעבדת EMG מתקדמת, המבצעת, בין היתר, גם בדיקות של סיב שריר בודד, בדיקות סוגרים, מיתרי קול ושרירי הנשימה, ובדיקות מיוחדות בילדים.